18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_06890 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_06940    100 
 
 
646 bp  1281    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06890    100 
 
 
646 bp  1281    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0352243  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23610    87.78 
 
 
889 bp  91.7  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.574272  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0286  transposase  87.95 
 
 
396 bp  85.7  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0497  transposase  87.95 
 
 
396 bp  85.7  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0373343  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0482    87.95 
 
 
898 bp  85.7  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0987444 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0584    87.95 
 
 
898 bp  85.7  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5549    87.95 
 
 
898 bp  85.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.093894 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13900  transposase  86.9 
 
 
384 bp  79.8  0.0000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.707887  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20970  transposase  86.9 
 
 
384 bp  79.8  0.0000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25860  transposase  92.86 
 
 
913 bp  60  0.0000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00370  transposase  92.86 
 
 
913 bp  60  0.0000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.632263  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05130  transposase  92.86 
 
 
913 bp  60  0.0000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0281    87.72 
 
 
874 bp  58  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.801624  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19860    83.33 
 
 
384 bp  56  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.85437  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19870    83.13 
 
 
447 bp  54  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.368618  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11174  transposase  87.04 
 
 
864 bp  52  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11059  transposase  87.04 
 
 
438 bp  52  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>