20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_23610 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_23610    100 
 
 		 889 bp  1762    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.574272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0286  transposase  89.29 
 
 		 396 bp  95.6  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0497  transposase  89.29 
 
 		 396 bp  95.6  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0373343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0482    89.29 
 
 		 898 bp  95.6  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0987444 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0584    89.29 
 
 		 898 bp  95.6  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5549    89.29 
 
 		 898 bp  95.6  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.093894 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06940    87.78 
 
 		 646 bp  91.7  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06890    87.78 
 
 		 646 bp  91.7  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0352243  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19860    90.2 
 
 		 384 bp  61.9  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.85437  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0285  transposase, IS4 family protein  92.31 
 
 		 555 bp  54  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0496  transposase, IS4 family protein  92.31 
 
 		 555 bp  54  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00295352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06950  hypothetical protein  82.76 
 
 		 285 bp  54  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06880  hypothetical protein  82.76 
 
 		 285 bp  54  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0485917  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13900  transposase  89.13 
 
 		 384 bp  52  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.707887  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20970  transposase  89.13 
 
 		 384 bp  52  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5939  hypothetical protein  90.48 
 
 		 800 bp  52  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.754111  normal  0.0437323 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00680    91.67 
 
 		 264 bp  48.1  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11174  transposase  86.54 
 
 		 864 bp  48.1  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11059  transposase  86.54 
 
 		 438 bp  48.1  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0204    100 
 
 		 480 bp  48.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>