More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_6370 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008062  Bcen_6370  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
317 aa  633  1e-180  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.848432  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1708  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  99.68 
 
 
367 aa  632  1e-180  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1723  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  99.37 
 
 
365 aa  630  1e-179  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.159328  normal  0.335799 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1450  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  90.45 
 
 
371 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2991  ABC transporter, inner membrane subunit  90.13 
 
 
371 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.400376  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4999  ABC transporter, inner membrane subunit  93.04 
 
 
370 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.861367  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2633  ABC transporter, permease protein  71.75 
 
 
365 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000522805  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2491  ABC transporter, permease protein  71.75 
 
 
365 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0223413  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2545  ABC transporter, permease protein  71.75 
 
 
365 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.16354  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1980  ABC transporter, permease protein  72.79 
 
 
349 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000012638  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.82 
 
 
368 aa  444  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000209026  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3206  ABC transporter, permease protein  71.75 
 
 
365 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0176532  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1605  ABC transporter, permease protein  71.75 
 
 
365 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.0000276043  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1380  ABC transporter, permease protein  71.75 
 
 
365 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.25604  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1638  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  70.16 
 
 
368 aa  442  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.488857  normal  0.189782 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2107  ABC transporter, permease protein  71.75 
 
 
365 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00353314  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1102  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.48 
 
 
341 aa  439  9.999999999999999e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1381  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  73.11 
 
 
367 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000782802  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  74.92 
 
 
374 aa  436  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.671417 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  75.24 
 
 
374 aa  435  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0696851 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1962  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  72.56 
 
 
365 aa  435  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.576949 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  75.9 
 
 
376 aa  435  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  72.56 
 
 
365 aa  435  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1235  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  69.21 
 
 
341 aa  431  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  71.29 
 
 
365 aa  432  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.578437 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5369  ABC transporter, inner membrane subunit  72.26 
 
 
365 aa  427  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.368099  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6017  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  71.29 
 
 
365 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.996581  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2079  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  71.29 
 
 
365 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0272405  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2060  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  71.29 
 
 
365 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.056455  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2127  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  73.94 
 
 
374 aa  423  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.472813  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1175  transmembrane ABC transporter protein  71.01 
 
 
374 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00089412  normal  0.471731 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2743  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.64 
 
 
348 aa  399  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1916  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.86 
 
 
365 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3252  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.51 
 
 
363 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.21 
 
 
365 aa  395  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.355781  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.99 
 
 
379 aa  394  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.122732  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.86 
 
 
380 aa  397  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00168824  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2015  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.86 
 
 
351 aa  392  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.263869  normal  0.632538 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.78 
 
 
346 aa  392  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0646948 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2975  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.71 
 
 
379 aa  387  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129813  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.29 
 
 
376 aa  379  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.303912 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1465  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.36 
 
 
343 aa  363  2e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.120778  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1273  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.66 
 
 
371 aa  350  2e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000032067 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2058  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.37 
 
 
339 aa  347  1e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.391891  normal  0.494478 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29670  oligopeptide ABC transporter, inner membrane permease component  55.23 
 
 
339 aa  343  2e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.175174  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3488  ABC transporter permease  54.58 
 
 
339 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4149  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.05 
 
 
339 aa  342  4e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0570261  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1716  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.05 
 
 
339 aa  342  4e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.937938  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3721  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.72 
 
 
339 aa  342  7e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0100075  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.14 
 
 
346 aa  341  9e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.94 
 
 
345 aa  341  1e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.327353 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.25 
 
 
340 aa  340  2e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3474  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.4 
 
 
339 aa  336  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41150  putative permease of ABC transporter  54.25 
 
 
339 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1756  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  53.42 
 
 
339 aa  332  3e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.974792  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2179  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  53.42 
 
 
339 aa  332  3e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1948  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.77 
 
 
368 aa  333  3e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0329294  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3719  ABC transporter, permease protein  53.09 
 
 
339 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1040  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  50.81 
 
 
360 aa  331  1e-89  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.522587 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.95 
 
 
355 aa  328  6e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0450  putative peptide transport system permease protein  52.3 
 
 
342 aa  328  7e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.540872  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2270  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.44 
 
 
357 aa  326  3e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0178  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.8 
 
 
347 aa  326  4.0000000000000003e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0202572  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0265  peptide ABC transporter, permease protein  50 
 
 
340 aa  325  5e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0779  ABC transporter, permease protein  50 
 
 
341 aa  325  6e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2412  inner membrane ABC transporter permease protein YejE  50.33 
 
 
341 aa  324  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0468301 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2569  inner membrane ABC transporter permease YejE  50.33 
 
 
341 aa  324  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00189075 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2458  inner membrane ABC transporter permease YejE  50.33 
 
 
341 aa  324  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.424248  normal  0.739807 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2455  inner membrane ABC transporter permease YejE  50.33 
 
 
341 aa  324  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000213093 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2367  inner membrane ABC transporter permease protein YejE  50.33 
 
 
341 aa  324  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0273884  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.67 
 
 
341 aa  323  3e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.152575  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2328  ABC transporter, permease protein  50 
 
 
341 aa  323  3e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0125701 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.16 
 
 
360 aa  323  3e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.318387 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02109  predicted oligopeptide transporter subunit  49.67 
 
 
341 aa  322  5e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.501538  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2317  ABC transporter, permease protein  49.67 
 
 
341 aa  322  5e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02068  hypothetical protein  49.67 
 
 
341 aa  322  5e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.543969  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0141  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  49.68 
 
 
340 aa  322  5e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3317  ABC transporter, permease protein  49.67 
 
 
341 aa  322  5e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.655724  normal  0.274397 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1468  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.67 
 
 
341 aa  322  5e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000790283  normal  0.119666 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2477  ABC transporter, permease protein  49.67 
 
 
341 aa  322  6e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.82 
 
 
338 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.588889 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0533  putative peptide ABC transporter, permease protein  50.48 
 
 
352 aa  319  3.9999999999999996e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2790  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.17 
 
 
338 aa  317  1e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.207956  normal  0.0893102 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3248  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.15 
 
 
341 aa  318  1e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.02975 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2635  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.92 
 
 
402 aa  315  6e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291012  normal  0.892203 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2434  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
341 aa  315  6e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.254964  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2648  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.84 
 
 
338 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3168  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  50 
 
 
346 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2904  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  48.86 
 
 
341 aa  308  9e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00718406  normal  0.256251 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3118  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  48.53 
 
 
340 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.42 
 
 
338 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.504144  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3075  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  47.73 
 
 
340 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3743  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  50 
 
 
340 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.379844  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2338  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.5 
 
 
341 aa  306  3e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0843  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.32 
 
 
343 aa  302  6.000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.562885  normal  0.0400765 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1914  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.87 
 
 
341 aa  301  7.000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.54 
 
 
341 aa  301  1e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2715  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.51 
 
 
338 aa  299  4e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.161854  normal  0.0734205 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2775  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.56 
 
 
341 aa  299  5e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0291  ABC transporter binding protein inner membrane protein  47.54 
 
 
349 aa  298  1e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>