12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5380 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_5380  hypothetical protein  100 
 
 		 94 aa  193  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5481  hypothetical protein  100 
 
 		 94 aa  193  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.143016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4821  hypothetical protein  89.36 
 
 		 109 aa  176  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0884  DNA-binding transcriptional regulator  45.45 
 
 		 187 aa  45.1  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.334392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2915  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 152 aa  44.7  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0871  transcriptional regulator, XRE family  31.18 
 
 		 170 aa  44.3  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.56743  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2735  helix-turn-helix domain-containing protein  35.29 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2168  transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 		 68 aa  43.9  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.117298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2734  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3452  XRE family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.663331  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0212  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1000  transcriptional regulator, XRE family  32.76 
 
 		 504 aa  40  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>