32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0585 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0555  hypothetical protein  99.01 
 
 
202 aa  423  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00222948  hitchhiker  0.00153836 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0585  hypothetical protein  100 
 
 
202 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0945656  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0103  hypothetical protein  100 
 
 
202 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.781875  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0488  hypothetical protein  91.09 
 
 
202 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.380914  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3670  hypothetical protein  94.55 
 
 
202 aa  384  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.176021  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0513  hypothetical protein  91.09 
 
 
202 aa  380  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.291945  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2798  hypothetical protein  89.6 
 
 
202 aa  360  9e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2519  putative lipoprotein  79.69 
 
 
195 aa  296  1e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0879276  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3520  putative lipoprotein  79.69 
 
 
195 aa  296  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.214963  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0441  putative lipoprotein  79.64 
 
 
185 aa  296  2e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1300  putative lipoprotein  79.64 
 
 
185 aa  296  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.132168  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3485  putative lipoprotein  79.64 
 
 
185 aa  296  2e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.723191  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3522  putative lipoprotein  79.64 
 
 
185 aa  296  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3263  putative lipoprotein  79.64 
 
 
185 aa  296  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1144  putative lipoprotein  79.17 
 
 
195 aa  295  3e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.443664  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0511  putative lipoprotein  68.65 
 
 
185 aa  276  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.31977  normal  0.814546 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3445  hypothetical protein  68.65 
 
 
185 aa  276  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00424122  hitchhiker  0.00406842 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2648  CNP1-like protein of unknown function  62.83 
 
 
192 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334196  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3102  hypothetical protein  45.26 
 
 
201 aa  121  7e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0646  putative lipoprotein  46.96 
 
 
173 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000213359  normal  0.146411 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1119  putative lipoprotein  39.13 
 
 
168 aa  111  9e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.195336  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2954  putative lipoprotein  38.67 
 
 
193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.818118  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3063  hypothetical protein  45.26 
 
 
209 aa  109  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.253023  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2653  hypothetical protein  44.53 
 
 
210 aa  106  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00481564  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0198  putative lipoprotein  34.29 
 
 
190 aa  102  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2818  putative lipoprotein  41.1 
 
 
213 aa  102  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0124705  normal  0.224694 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1229  hypothetical protein  34.48 
 
 
185 aa  93.6  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000243549  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1844  putative lipoprotein  41.27 
 
 
176 aa  92.8  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0351811  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0835  hypothetical protein  33.52 
 
 
173 aa  82.8  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.791477  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0747  hypothetical protein  35.46 
 
 
170 aa  77.8  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00218251 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4214  hypothetical protein  31.61 
 
 
176 aa  75.9  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.412207  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1272  hypothetical protein  28.57 
 
 
163 aa  59.7  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0527391  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>