16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3382 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3382  PilT protein domain protein  100 
 
 		 131 aa  239  1e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.337564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1717  PilT domain-containing protein  44.7 
 
 		 134 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13442  hypothetical protein  39.85 
 
 		 136 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.153139 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11990  hypothetical protein  42.11 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0797  PilT protein domain protein  41.27 
 
 		 130 aa  72  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.424953  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5531  hypothetical protein  38.46 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.37836 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5933  hypothetical protein  38.46 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0433671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2877  PilT protein-like  37.98 
 
 		 129 aa  62  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.013961  normal  0.385493 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13418  hypothetical protein  35.88 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000730946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2967  hypothetical protein  38.17 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0071399  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4432  hypothetical protein  37.68 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.352964 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1620  PilT protein domain protein  38.58 
 
 		 130 aa  51.2  0.000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26300  hypothetical protein  32.56 
 
 		 133 aa  47.4  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.835764  normal  0.0333034 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3324  PilT protein-like  37.29 
 
 		 147 aa  44.7  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.108302  normal  0.226575 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0088  hypothetical protein  36.03 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.713807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0086  hypothetical protein  36.03 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>