24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6307 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7179  hypothetical protein  89.56 
 
 		 412 aa  775    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.055566 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5487  hypothetical protein  88.83 
 
 		 412 aa  767    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.544992  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6307  hypothetical protein  100 
 
 		 412 aa  852    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.398194 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6773  hypothetical protein  88.83 
 
 		 412 aa  767    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.903776  normal  0.672585 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6011  hypothetical protein  96.6 
 
 		 412 aa  830    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.652248 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6361  hypothetical protein  88.83 
 
 		 412 aa  768    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3319  putative oxygenase subunit protein  69.02 
 
 		 413 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0147948  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1837  putative oxygenase subunit protein  65.11 
 
 		 416 aa  556  1e-157  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.272624  normal  0.145679 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1791  putative dehydrogenase/oxygenase subunit (flavoprotein)  62.9 
 
 		 431 aa  503  1e-141  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480723  normal  0.833555 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3469  putative oxygenase subunit protein  59.66 
 
 		 429 aa  491  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0690233  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3428  putative dehydrogenase/oxygenase subunit (flavoprotein)  57.61 
 
 		 412 aa  484  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251863  normal  0.249872 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5474  putative oxygenase subunit protein  54.05 
 
 		 408 aa  458  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.72272 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1344  putative oxygenase  48.74 
 
 		 413 aa  400  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00629654  hitchhiker  0.0000135484 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2912  putative oxygenase subunit protein  45.48 
 
 		 415 aa  348  1e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.69464 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2850  putative oxygenase subunit protein  41.98 
 
 		 421 aa  311  1e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0853  putative oxygenase subunit protein  33.99 
 
 		 417 aa  271  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0493  putative oxygenase subunit protein  36.12 
 
 		 418 aa  253  3e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33980  oxygenase subunit protein  37.73 
 
 		 405 aa  253  5.000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6219  putative oxidoreductase  33.1 
 
 		 461 aa  206  7e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5734  hypothetical protein  30.98 
 
 		 413 aa  184  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.422452  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4509  FAD dependent oxidoreductase  28.27 
 
 		 416 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.014564  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4435  putative monooxygenase  25.06 
 
 		 415 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.975242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4329  hypothetical protein  26.59 
 
 		 463 aa  106  7e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2115  monooxygenase  25.19 
 
 		 435 aa  101  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.827363  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>