41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6242 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6242  condensation domain-containing protein  100 
 
 		 406 aa  821    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6240  condensation domain-containing protein  40.49 
 
 		 492 aa  311  2e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.217969  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3898  condensation domain protein  33.25 
 
 		 415 aa  176  5e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0880  condensation domain-containing protein  28.82 
 
 		 416 aa  160  5e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0198363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5736  condensation domain-containing protein  27.32 
 
 		 417 aa  124  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.205763 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6489  condensation domain-containing protein  26.68 
 
 		 417 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21000  hypothetical protein  29.33 
 
 		 442 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.242529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1443  Alcohol acetyltransferase  23.98 
 
 		 424 aa  72.8  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3214  hypothetical protein  20.94 
 
 		 424 aa  62.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0128156  normal  0.655309 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4452  alcohol acetyltransferase  22.26 
 
 		 447 aa  61.2  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1444  condensation domain protein  23.1 
 
 		 437 aa  55.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2503  condensation domain protein  26.83 
 
 		 450 aa  52  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1845  peptide synthase  29.05 
 
 		 5654 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  27.74 
 
 		 3176 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.173269 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1928  hypothetical protein  19.59 
 
 		 415 aa  48.5  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3681  amino acid adenylation domain protein  27.97 
 
 		 1142 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5583  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  32.26 
 
 		 1806 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.786514 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3891  amino acid adenylation domain protein  32.12 
 
 		 1256 aa  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7298  peptide synthetase  31.33 
 
 		 2573 aa  46.6  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3466  amino acid adenylation  28.05 
 
 		 1745 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0192  amino acid adenylation domain-containing protein  25.93 
 
 		 1914 aa  46.2  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.33939 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3740  amino acid adenylation domain protein  21.32 
 
 		 2395 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.209532 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3529  amino acid adenylation domain-containing protein  28.05 
 
 		 1745 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3686  amino acid adenylation domain protein  21.32 
 
 		 2395 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3477  amino acid adenylation domain-containing protein  28.05 
 
 		 1745 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0634623  normal  0.144372 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  29.14 
 
 		 5328 aa  45.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  26.04 
 
 		 4747 aa  44.7  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  21.97 
 
 		 3308 aa  45.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1887  amino acid adenylation domain protein  27.48 
 
 		 2614 aa  44.3  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2208  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  29.75 
 
 		 1829 aa  43.9  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190766  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  29.13 
 
 		 3470 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  25.83 
 
 		 8646 aa  43.5  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5191  amino acid adenylation domain protein  24.29 
 
 		 9175 aa  43.5  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.233499 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5190  amino acid adenylation domain protein  26.75 
 
 		 7168 aa  43.5  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000112945 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  25.33 
 
 		 5149 aa  43.5  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3732  amino acid adenylation domain protein  29.75 
 
 		 6113 aa  43.5  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6557  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  28.11 
 
 		 2320 aa  43.1  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000475071 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3546  amino acid adenylation domain-containing protein  27.45 
 
 		 3404 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2719  amino acid adenylation domain protein  28.68 
 
 		 3410 aa  43.1  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3725  polyketide synthase modules and related proteins-like  23.53 
 
 		 3111 aa  43.1  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.816556 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  31.47 
 
 		 4502 aa  43.1  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>