20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6213 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6213  small integral membrane protein  100 
 
 		 113 aa  225  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5940  small integral membrane protein  100 
 
 		 113 aa  225  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7358  small integral membrane protein  91.96 
 
 		 113 aa  193  7e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.585569 
 
 
-
 
NC_003296  RS02124  hypothetical protein  86.73 
 
 		 112 aa  178  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3799  hypothetical protein  82.61 
 
 		 115 aa  168  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4876  hypothetical protein  82.61 
 
 		 115 aa  168  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0975253 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3959  hypothetical protein  67.52 
 
 		 117 aa  156  9e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.281179  normal  0.0264743 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0730  hypothetical protein  77.78 
 
 		 115 aa  153  9e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3636  hypothetical protein  65.52 
 
 		 121 aa  145  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.678182  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5126  hypothetical protein  76.7 
 
 		 104 aa  137  6e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2264  conserved hypothetical conserved membrane protein  58.04 
 
 		 123 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.153108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2429  hypothetical protein  54.39 
 
 		 118 aa  124  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0250  hypothetical protein  68.27 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00978693 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2478  hypothetical protein  59 
 
 		 124 aa  120  7e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2362  cytochrome c oxidase subunit IV  60 
 
 		 110 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3894  cytochrome c oxidase subunit IV  57.45 
 
 		 109 aa  118  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.798918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2590  conserved hypothetical conserved membrane protein  55.56 
 
 		 121 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.585354  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2341  cytochrome c oxidase, subunit IV  48.25 
 
 		 114 aa  75.9  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5676  hypothetical protein  30.84 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.967687 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3465  hypothetical protein  28.16 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0320908 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>