19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6137 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6137  hypothetical protein  100 
 
 		 363 aa  702    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.295579  normal  0.0515826 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7424  hypothetical protein  92.84 
 
 		 363 aa  592  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0373604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6506  hypothetical protein  90.66 
 
 		 364 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.995257 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5650  hypothetical protein  90.38 
 
 		 364 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16977  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6015  hypothetical protein  90.38 
 
 		 364 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00375312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0706  hypothetical protein  42.38 
 
 		 346 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0663628  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2889  hypothetical protein  42.38 
 
 		 346 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0540  hypothetical protein  42.38 
 
 		 346 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1461  hypothetical protein  42.38 
 
 		 346 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0127  hypothetical protein  42.38 
 
 		 346 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3157  hypothetical protein  42.38 
 
 		 346 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0522  hypothetical protein  42.01 
 
 		 346 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.724316  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3808  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein)-like protein  31.08 
 
 		 339 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0424  hypothetical protein  28.36 
 
 		 344 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.938992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4271  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  28.47 
 
 		 341 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0416892  hitchhiker  0.000248822 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0139  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III  27.24 
 
 		 340 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0418  hypothetical protein  29.76 
 
 		 330 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0133  hypothetical protein  29.11 
 
 		 353 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4277  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  29.47 
 
 		 346 aa  43.1  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141779 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>