23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5310 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_5310  amidinotransferase  100 
 
 		 346 aa  706    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3491  amidinotransferase  95.78 
 
 		 333 aa  645    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.736651  normal  0.0264598 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3576  amidinotransferase  88.66 
 
 		 354 aa  616  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0346338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2543  amidinotransferase  89.16 
 
 		 333 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3944  amidinotransferase  88.82 
 
 		 336 aa  590  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.271139  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00362  hypothetical protein  72.64 
 
 		 319 aa  434  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.117319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2391  hypothetical protein  68 
 
 		 305 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.482221  normal  0.798046 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1164  amidinotransferase family protein  63.14 
 
 		 309 aa  392  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0253709 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02830  uncharacterized conserved protein with pentein-type domain  57.19 
 
 		 340 aa  366  1e-100  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2023  amidinotransferase family protein  55.52 
 
 		 362 aa  360  1e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.136244  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1270  hypothetical protein  42.9 
 
 		 309 aa  246  4e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0193  hypothetical protein  42.02 
 
 		 309 aa  236  4e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05890  hypothetical protein  41.69 
 
 		 309 aa  236  6e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0365  pentein-type domain-containing protein  40.32 
 
 		 311 aa  234  1.0000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.529714  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1720  pentein-type domain-containing protein  40.98 
 
 		 310 aa  231  1e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0873915  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5776  hypothetical protein  39.41 
 
 		 318 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4680  hypothetical protein  37.99 
 
 		 308 aa  206  5e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0243  hypothetical protein  39.42 
 
 		 326 aa  200  1.9999999999999998e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001028  hypothetical protein  37.66 
 
 		 333 aa  192  5e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07112  hypothetical protein  38.54 
 
 		 336 aa  187  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2881  hypothetical protein  36.6 
 
 		 303 aa  186  5e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2742  hypothetical protein  36.27 
 
 		 303 aa  186  7e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31738  predicted protein  41.33 
 
 		 302 aa  174  9.999999999999999e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.193058  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>