37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5138 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_5138  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  478  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2897  hypothetical protein  85.78 
 
 		 233 aa  374  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4808  hypothetical protein  80.72 
 
 		 226 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0290203  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3359  hypothetical protein  80.72 
 
 		 226 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1902  hypothetical protein  61.41 
 
 		 209 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1324  hypothetical protein  47.7 
 
 		 200 aa  177  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.837518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1770  hypothetical protein  47.7 
 
 		 200 aa  176  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0150338  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1778  protein of unknown function DUF1105  47.7 
 
 		 200 aa  176  4e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.004863  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2092  hypothetical protein  47.13 
 
 		 239 aa  176  4e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000442372  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01833  hypothetical protein  47.13 
 
 		 200 aa  174  9e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.64408  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01821  hypothetical protein  47.13 
 
 		 200 aa  174  9e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.500507  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1955  hypothetical protein  47.13 
 
 		 233 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.316298  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2598  hypothetical protein  47.13 
 
 		 200 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.19115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2056  hypothetical protein  43.23 
 
 		 199 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0690594 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2051  hypothetical protein  43.23 
 
 		 199 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1351  hypothetical protein  43.72 
 
 		 198 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00554974 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1226  hypothetical protein  43.68 
 
 		 199 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.151738  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2111  hypothetical protein  42.71 
 
 		 199 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0232876 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1858  hypothetical protein  39.73 
 
 		 191 aa  86.3  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.452137 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3580  hypothetical protein  36.07 
 
 		 187 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.37054 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4173  hypothetical protein  36.42 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0580718 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4194  hypothetical protein  36.42 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.118135  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3344  hypothetical protein  38.31 
 
 		 191 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4060  hypothetical protein  36.07 
 
 		 187 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.892529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5397  putative peptidoglycan peptidase  28.09 
 
 		 202 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.75076 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03772  hypothetical protein  28.09 
 
 		 202 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.608864  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03823  predicted peptidoglycan peptidase  28.09 
 
 		 202 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.632125  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4078  putative peptidoglycan peptidase  28.09 
 
 		 202 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4475  putative peptidoglycan peptidase  28.09 
 
 		 202 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.482893  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4170  putative peptidoglycan peptidase  28.09 
 
 		 202 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4379  putative peptidoglycan peptidase  27.53 
 
 		 202 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.472041 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4423  putative peptidoglycan peptidase  27.53 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.770264  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4048  protein of unknown function DUF1105  26.97 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3368  putative peptidoglycan peptidase  27.27 
 
 		 206 aa  50.1  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3515  putative peptidoglycan peptidase  26.11 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7166  putative peptidoglycan peptidase  21.86 
 
 		 210 aa  47  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.137529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3647  putative peptidoglycan peptidase  25.97 
 
 		 218 aa  43.9  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>