14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4011 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4011  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  220  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0385813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4473  hypothetical protein  99.09 
 
 		 159 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4062  hypothetical protein  92.73 
 
 		 156 aa  166  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3784  hypothetical protein  88.61 
 
 		 111 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.297635  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4584  hypothetical protein  88.61 
 
 		 111 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.468357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5721  hypothetical protein  88.61 
 
 		 111 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.23173  normal  0.174621 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1259  hypothetical protein  88.61 
 
 		 190 aa  147  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3882  hypothetical protein  65.77 
 
 		 183 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.403494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0619  hypothetical protein  51 
 
 		 214 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0250635 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4290  hypothetical protein  52.04 
 
 		 156 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.951084  normal  0.208948 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0034  hypothetical protein  37.25 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3808  putative lipoprotein  37.25 
 
 		 123 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3868  putative lipoprotein  37.25 
 
 		 135 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3127  hypothetical protein  34.4 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.125596  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>