24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3507 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3507  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3990  hypothetical protein  98.88 
 
 		 179 aa  360  9e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.188727 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4491  hypothetical protein  94.05 
 
 		 178 aa  325  3e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.959725 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3427  hypothetical protein  90.64 
 
 		 174 aa  318  3e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1949  hypothetical protein  90.64 
 
 		 174 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.285609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4096  hypothetical protein  91.23 
 
 		 174 aa  317  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.41612 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4270  hypothetical protein  91.23 
 
 		 174 aa  317  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0363  L-2-amino-thiazoline-4-carboxylic acid hydrolase  79.19 
 
 		 427 aa  275  2e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.307469  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0641  hypothetical protein  79.19 
 
 		 427 aa  275  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.453746  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1261  L-2-amino-thiazoline-4-carboxylic acid hydrolase domain-containing protein  79.19 
 
 		 427 aa  275  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1187  L-2-amino-thiazoline-4-carboxylic acid hydrolase domain-containing protein  79.19 
 
 		 430 aa  275  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0440226  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0929  L-2-amino-thiazoline-4-carboxylic acid hydrolase  79.19 
 
 		 427 aa  275  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.604577  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2455  L-2-amino-thiazoline-4-carboxylic acid hydrolase  79.19 
 
 		 408 aa  275  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0349208  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1547  L-2-amino-thiazoline-4-carboxylic acid hydrolase  78.7 
 
 		 272 aa  269  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2554  hypothetical protein  68.63 
 
 		 168 aa  223  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2911  L-2-amino-thiazoline-4-carboxylic acid hydrolase  63.06 
 
 		 161 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.264333  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3315  L-2-amino-thiazoline-4-carboxylic acid hydrolase  46.75 
 
 		 162 aa  158  4e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.537977  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3220  L-2-amino-thiazoline-4-carboxylic acid hydrolase  42.86 
 
 		 169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2872  L-2-amino-thiazoline-4-carboxylic acid hydrolase  38.12 
 
 		 163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3173  hypothetical protein  33.56 
 
 		 150 aa  98.2  5e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1480  L-2-amino-thiazoline-4-carboxylic acid hydrolase  31.29 
 
 		 158 aa  92.8  3e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0360  hypothetical protein  39.71 
 
 		 222 aa  45.8  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0018  hypothetical protein  37.5 
 
 		 193 aa  44.7  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.215123  normal  0.56065 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0568  hypothetical protein  31.68 
 
 		 208 aa  44.7  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>