13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3418 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3418  Flp/Fap pilin component  100 
 
 		 59 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.552051 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3925  Flp/Fap pilin component  88.14 
 
 		 59 aa  101  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165585  normal  0.180992 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2060  Flp/Fap pilin component  83.33 
 
 		 93 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0485753  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2462  Flp/Fap pilin component family protein  61.4 
 
 		 63 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.297341  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2037  putative fimbriae assembly-related protein  58.62 
 
 		 63 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1683  hypothetical protein  58.62 
 
 		 63 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0339  putative fimbriae assembly-related protein  58.62 
 
 		 63 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1870  Flp/Fap pilin  58.62 
 
 		 63 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1882  Flp/Fap pilin  58.62 
 
 		 63 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.235702  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0822  hypothetical protein  58.62 
 
 		 63 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0250805  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4611  Flp/Fap pilin component  41.18 
 
 		 58 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.699189 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55940  hypothetical protein  45.76 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0175514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4873  hypothetical protein  44.83 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0822533  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>