19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3126 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_3126  hypothetical protein  100 
 
 		 68 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2989  hypothetical protein  98.53 
 
 		 68 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.0284485 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6428  hypothetical protein  92.65 
 
 		 68 aa  122  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.787904 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2464  hypothetical protein  91.18 
 
 		 68 aa  121  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3096  hypothetical protein  91.18 
 
 		 68 aa  121  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712567 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3078  hypothetical protein  91.18 
 
 		 68 aa  121  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3075  hypothetical protein  89.86 
 
 		 69 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.233607 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2161  hypothetical protein  77.94 
 
 		 68 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3419  hypothetical protein  77.94 
 
 		 68 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0215  hypothetical protein  77.94 
 
 		 68 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.520842  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0399  membrane protein-related protein  77.94 
 
 		 97 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2928  hypothetical protein  77.94 
 
 		 68 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0202  hypothetical protein  76.47 
 
 		 68 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0081  hypothetical protein  70.59 
 
 		 66 aa  94.7  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0354  hypothetical protein  58.82 
 
 		 68 aa  88.6  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.604079 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4368  hypothetical protein  58.82 
 
 		 68 aa  88.2  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1580  membrane protein  37.31 
 
 		 69 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1770  membrane protein  33.93 
 
 		 69 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0396  membrane protein  38.1 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>