41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0673 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_0673  phosphoesterase, PA-phosphatase related  100 
 
 		 205 aa  407  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.918939  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3885  phosphoesterase, PA-phosphatase related  96.59 
 
 		 205 aa  394  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2878  hypothetical protein  24.65 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.259578  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1932  phosphatase  25.43 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0283031  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2666  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.55 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000403275  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4138  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.66 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3720  phosphatase  27.32 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4862  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.08 
 
 		 235 aa  57  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2121  Ser/Thr and Tyr protein phosphatase (dual specificity)#  29.17 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000187459  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2865  hypothetical protein  30.19 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.423571 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2884  Dual specificity protein phosphatase  30.1 
 
 		 437 aa  55.1  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.170107  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4419  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  27.03 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3589  putative PAP2 family protein  29.11 
 
 		 219 aa  52.8  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000468424  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5140  PAP2 family protein  29.11 
 
 		 215 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000194372  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5133  PAP2 family protein  29.11 
 
 		 215 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000713606  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5104  PAP2 family protein  29.11 
 
 		 215 aa  52  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4824  PAP2 family protein  29.75 
 
 		 215 aa  52  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00045347  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4721  PAP2 family protein  29.11 
 
 		 215 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00298694  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4706  PAP2 family protein  29.11 
 
 		 215 aa  51.6  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0195137  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5238  PAP2 family protein  29.75 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.108629  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4866  PAP2 family protein  29.75 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282445  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00861  hypothetical protein  30.46 
 
 		 220 aa  49.7  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5138  PAP2 family protein  28.48 
 
 		 215 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000319321  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0102  PAP2 family protein  28.48 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000373231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3979  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.18 
 
 		 222 aa  48.5  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01378  hypothetical protein  31.71 
 
 		 430 aa  48.1  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2234  putative dual specificity phosphatase  31.71 
 
 		 438 aa  48.1  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1631  PAP2 family protein  31.71 
 
 		 430 aa  48.1  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.832741  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01366  predicted phosphatase, inner membrane protein  31.71 
 
 		 430 aa  48.1  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1592  PAP2 family protein  31.71 
 
 		 430 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1848  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.02 
 
 		 238 aa  46.6  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2238  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  29.07 
 
 		 242 aa  45.8  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3303  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.53 
 
 		 242 aa  45.4  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.306243  normal  0.430535 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1761  PAP2 family protein  30.59 
 
 		 430 aa  45.1  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113055 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2247  putative dual specificity phosphatase  31.1 
 
 		 438 aa  44.3  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1494  PAP2 family protein  31.1 
 
 		 430 aa  44.3  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2010  hypothetical protein  38.67 
 
 		 276 aa  44.3  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0105521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4168  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.44 
 
 		 237 aa  42.7  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2361  putative dual specificity phosphatase  30.28 
 
 		 428 aa  42.7  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3204  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  29.11 
 
 		 350 aa  42.7  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.139548  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2014  PAP2 family protein  30.49 
 
 		 430 aa  42  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.106325 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>