14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6727 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6727  hypothetical protein  100 
 
 
114 aa  236  5.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3429  hypothetical protein  96.49 
 
 
114 aa  229  7.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.379569  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0797  hypothetical protein  43.36 
 
 
117 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0825  hypothetical protein  43.36 
 
 
117 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2803  hypothetical protein  45.45 
 
 
117 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.132031 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3756  hypothetical protein  42.34 
 
 
114 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3805  hypothetical protein  42.34 
 
 
114 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1519  hypothetical protein  38.6 
 
 
114 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.91917 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0100  hypothetical protein  43.24 
 
 
114 aa  94.4  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3678  hypothetical protein  43.24 
 
 
117 aa  93.6  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.488744  hitchhiker  0.00469689 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2306  hypothetical protein  42.34 
 
 
112 aa  92  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.440249 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2645  hypothetical protein  42.34 
 
 
112 aa  91.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1597  hypothetical protein  40.91 
 
 
114 aa  90.1  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156174  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0808  hypothetical protein  36.28 
 
 
113 aa  88.2  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>