16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1597 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1597  hypothetical protein  100 
 
 
114 aa  231  3e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156174  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0100  hypothetical protein  57.02 
 
 
114 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3756  hypothetical protein  49.55 
 
 
114 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3805  hypothetical protein  49.55 
 
 
114 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0808  hypothetical protein  49.53 
 
 
113 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2803  hypothetical protein  45.87 
 
 
117 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.132031 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0797  hypothetical protein  43.75 
 
 
117 aa  100  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0825  hypothetical protein  43.75 
 
 
117 aa  100  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1519  hypothetical protein  44.14 
 
 
114 aa  98.2  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.91917 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3429  hypothetical protein  39.64 
 
 
114 aa  90.1  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.379569  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6727  hypothetical protein  40.91 
 
 
114 aa  90.1  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2306  hypothetical protein  45.83 
 
 
112 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.440249 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2645  hypothetical protein  44.79 
 
 
112 aa  82.8  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3678  hypothetical protein  42.11 
 
 
117 aa  82.4  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.488744  hitchhiker  0.00469689 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0023  hypothetical protein  33.96 
 
 
113 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.807557  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3681  methyltransferase type 11  25.74 
 
 
392 aa  45.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.10775 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>