29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6551 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6551  hypothetical protein  100 
 
 		 400 aa  838    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5565  hypothetical protein  78.99 
 
 		 401 aa  657    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.753829 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1545  hypothetical protein  34.57 
 
 		 393 aa  265  1e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5210  hypothetical protein  34.57 
 
 		 393 aa  265  1e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6284  hypothetical protein  34.18 
 
 		 392 aa  249  5e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.551887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3354  transcriptional activator FlhC  27.27 
 
 		 184 aa  55.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal  0.381268 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3819  transcriptional activator FlhC  28 
 
 		 186 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.760838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0178  transcriptional activator FlhC  27.27 
 
 		 184 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0165  transcriptional activator FlhC  27.27 
 
 		 184 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1306  transcriptional activator FlhC  29.05 
 
 		 181 aa  52.4  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0234  transcriptional activator FlhC  26.62 
 
 		 184 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0115  transcriptional activator FlhC  26.59 
 
 		 186 aa  51.6  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.533047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3186  transcriptional activator FlhC  25.32 
 
 		 183 aa  50.4  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.124495  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3439  transcriptional activator FlhC  25.73 
 
 		 183 aa  50.1  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3112  transcriptional activator FlhC  25.73 
 
 		 183 aa  50.1  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3940  transcriptional activator FlhC  25.73 
 
 		 183 aa  50.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3859  transcriptional activator FlhC  25.73 
 
 		 183 aa  50.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1680  transcriptional activator FlhC  25.73 
 
 		 183 aa  50.1  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.840947  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0252  transcriptional activator FlhC  25.97 
 
 		 184 aa  50.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.260782  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2855  transcriptional activator FlhC  25.97 
 
 		 184 aa  50.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.382848  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0081  transcriptional activator FlhC  25.73 
 
 		 183 aa  50.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2863  transcriptional activator FlhC  25.73 
 
 		 183 aa  50.1  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0161  transcriptional activator FlhC  26.62 
 
 		 198 aa  49.7  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1942  transcriptional activator FlhC  26.97 
 
 		 182 aa  48.9  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1241  transcriptional activator FlhC  26.83 
 
 		 184 aa  47.8  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2978  transcriptional activator FlhC  24.29 
 
 		 203 aa  47.8  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000050708 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4156  transcriptional activator FlhC  25.17 
 
 		 186 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4044  transcriptional activator FlhC  25.17 
 
 		 186 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5605  transcriptional activator FlhC  25.47 
 
 		 201 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.31133  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>