16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1545 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1545  hypothetical protein  100 
 
 		 393 aa  818    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5210  hypothetical protein  100 
 
 		 393 aa  818    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5565  hypothetical protein  36.34 
 
 		 401 aa  265  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.753829 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6551  hypothetical protein  34.57 
 
 		 400 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6284  hypothetical protein  36.48 
 
 		 392 aa  262  8.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.551887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2027  transcriptional activator FlhC  27.97 
 
 		 203 aa  48.9  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000461125  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0161  transcriptional activator FlhC  29.5 
 
 		 198 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2855  transcriptional activator FlhC  28.78 
 
 		 184 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.382848  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0252  transcriptional activator FlhC  28.78 
 
 		 184 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.260782  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0234  transcriptional activator FlhC  29.5 
 
 		 184 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3354  transcriptional activator FlhC  28.37 
 
 		 184 aa  44.3  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal  0.381268 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1509  transcriptional activator FlhC  27.08 
 
 		 193 aa  44.3  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0026614  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0165  transcriptional activator FlhC  27.54 
 
 		 184 aa  44.3  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0178  transcriptional activator FlhC  27.54 
 
 		 184 aa  44.3  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2978  transcriptional activator FlhC  28.87 
 
 		 203 aa  43.9  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000050708 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1537  transcriptional activator FlhC  27.08 
 
 		 193 aa  43.5  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00505633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>