12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5862 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5862  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  271  3e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.454154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6101  hypothetical protein  92.72 
 
 		 151 aa  173  6e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.69699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7537  hypothetical protein  64.52 
 
 		 155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6566  hypothetical protein  65 
 
 		 160 aa  130  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.238905 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6082  hypothetical protein  63.12 
 
 		 160 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5718  hypothetical protein  63.75 
 
 		 160 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.467116  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6009  hypothetical protein  76.64 
 
 		 171 aa  95.5  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2121  hypothetical protein  39.29 
 
 		 148 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.460411  hitchhiker  0.00638074 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2096  hypothetical protein  40.48 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.413593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1974  hypothetical protein  42.17 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0227032 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3795  hypothetical protein  42.17 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.100571 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2499  hypothetical protein  45.45 
 
 		 160 aa  51.6  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0165964  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>