22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2493 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2493  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.236869  normal  0.998378 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5905  hypothetical protein  91.86 
 
 		 221 aa  378  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2622  hypothetical protein  97.74 
 
 		 221 aa  349  2e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1963  hypothetical protein  93.67 
 
 		 221 aa  348  4e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.957184  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2574  hypothetical protein  93.67 
 
 		 221 aa  348  4e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2598  hypothetical protein  92.76 
 
 		 221 aa  344  5e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2094  conserved transmembrane protein  74.88 
 
 		 226 aa  300  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0723  hypothetical protein  84.51 
 
 		 225 aa  295  3e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.174182 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2174  transmembrane protein  72.73 
 
 		 225 aa  292  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0089  hypothetical protein  72.51 
 
 		 225 aa  268  5e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.081156  normal  0.324813 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0756  hypothetical protein  63.38 
 
 		 219 aa  236  3e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.144399  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7221  hypothetical protein  42.41 
 
 		 199 aa  115  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.288323 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1020  hypothetical protein  37.75 
 
 		 200 aa  102  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.113619  normal  0.37406 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2983  hypothetical protein  36.18 
 
 		 210 aa  99.4  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000560028  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0337  hypothetical protein  41.95 
 
 		 211 aa  93.6  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2870  hypothetical protein  36.15 
 
 		 222 aa  90.9  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.922239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4188  hypothetical protein  37.02 
 
 		 203 aa  86.3  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5040  hypothetical protein  35.78 
 
 		 221 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0084  hypothetical protein  41.01 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.898737  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6316  hypothetical protein  39.18 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.843909  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1370  hypothetical protein  32.13 
 
 		 232 aa  64.7  0.0000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.73391  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1418  Gram-positive anchor  34.85 
 
 		 262 aa  48.9  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248411  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>