19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0115 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0115  hypothetical protein  100 
 
 
277 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4012  hypothetical protein  43.59 
 
 
274 aa  228  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1397  hypothetical protein  41.01 
 
 
289 aa  193  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.157715  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1324  hypothetical protein  43.53 
 
 
279 aa  181  9.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431551  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0516  hypothetical protein  31.9 
 
 
172 aa  59.7  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4698  putative lipoprotein  31.9 
 
 
172 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000879271 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0640  putative lipoprotein  31.9 
 
 
172 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0569  putative lipoprotein  31.03 
 
 
173 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000903334  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0658  putative lipoprotein  31.03 
 
 
172 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.9941600000000005e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0729  putative lipoprotein  31.03 
 
 
172 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0602  putative lipoprotein  31.03 
 
 
172 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0513  hypothetical protein  31.03 
 
 
173 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000669276  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0511  hypothetical protein  31.03 
 
 
173 aa  58.5  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0779722  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0670  hypothetical protein  31.03 
 
 
172 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0529  hypothetical protein  32.79 
 
 
372 aa  57.4  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6677  hypothetical protein  39.36 
 
 
545 aa  56.6  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.217849  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0520  hypothetical protein  29.41 
 
 
172 aa  51.6  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4077  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.5 
 
 
3602 aa  48.9  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3731  hypothetical protein  27.27 
 
 
456 aa  45.8  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>