17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A0805 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A0805  hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2488  hypothetical protein  100 
 
 
123 aa  236  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0109549  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2350  hypothetical protein  100 
 
 
123 aa  236  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0651  hypothetical protein  84.55 
 
 
124 aa  206  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0781169  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7087  putative transmembrane protein  67.48 
 
 
123 aa  156  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03755  hypothetical protein  68.64 
 
 
122 aa  145  6e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4830  putative transmembrane protein  60 
 
 
129 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.973163  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3753  putative transmembrane protein  60 
 
 
129 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.196482  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2680  hypothetical protein  55 
 
 
123 aa  121  8e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.776362  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3704  hypothetical protein  48.78 
 
 
146 aa  107  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.385221 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2574  hypothetical protein  38.02 
 
 
138 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2339  hypothetical protein  41.32 
 
 
133 aa  71.6  0.000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.964598  normal  0.0789899 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2717  hypothetical protein  41.32 
 
 
133 aa  71.6  0.000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.22005  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0518  hypothetical protein  42.57 
 
 
131 aa  61.2  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3285  hypothetical protein  39.78 
 
 
120 aa  43.5  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0224  hypothetical protein  23.01 
 
 
120 aa  42  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000354158  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6934  hypothetical protein  33.68 
 
 
129 aa  41.6  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.772274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>