18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_1096 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_1096  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  267  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.410238  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2134  hypothetical protein  100 
 
 
111 aa  220  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0947  hypothetical protein  99.1 
 
 
111 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.593029  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0943  hypothetical protein  99.1 
 
 
111 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.100302  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0549  hypothetical protein  52.05 
 
 
103 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0514005 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3185  hypothetical protein  41.1 
 
 
101 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0257784 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5866  hypothetical protein  43.48 
 
 
107 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.665282  normal  0.247106 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0760  hypothetical protein  47.83 
 
 
103 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0668684  normal  0.055839 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2559  hypothetical protein  40.71 
 
 
107 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00790173 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1923  hypothetical protein  37.5 
 
 
107 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.26903  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2535  hypothetical protein  37.5 
 
 
107 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00615729  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2453  hypothetical protein  46.03 
 
 
107 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000403685 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2583  hypothetical protein  46.03 
 
 
107 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0792803  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0209  hypothetical protein  33.33 
 
 
112 aa  50.4  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0252  hypothetical protein  32.5 
 
 
113 aa  43.9  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0706  hypothetical protein  39.13 
 
 
129 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.237849  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4703  hypothetical protein  33.33 
 
 
120 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974877 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3626  hypothetical protein  33.33 
 
 
120 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>