22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_0963 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_0963  hypothetical protein  100 
 
 		 365 aa  749    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.369617  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0803  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2315  hypothetical protein  25.34 
 
 		 296 aa  96.3  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.106853  hitchhiker  0.000000000000558489 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08196  hypothetical protein  27.24 
 
 		 274 aa  92.4  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  hitchhiker  0.00000170796  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0261  hypothetical protein  25.68 
 
 		 303 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.205526  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0074  hypothetical protein  22.26 
 
 		 309 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000070418  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0566  hypothetical protein  32.79 
 
 		 288 aa  75.5  0.000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00656687 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1612  hypothetical protein  26.48 
 
 		 269 aa  73.9  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2563  hypothetical protein  24.19 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1649  hypothetical protein  27.61 
 
 		 274 aa  65.9  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.432038  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0798  hypothetical protein  23.08 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02980  hypothetical protein  25.21 
 
 		 330 aa  62.4  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2823  hypothetical protein  27.21 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6250  hypothetical protein  23.13 
 
 		 310 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.139309  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0653  hypothetical protein  23.76 
 
 		 285 aa  55.1  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.395081  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0056  hypothetical protein  20.45 
 
 		 287 aa  53.5  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000186467 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3495  hypothetical protein  22.22 
 
 		 276 aa  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1885  hypothetical protein  21.6 
 
 		 288 aa  52  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.911612 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2640  hypothetical protein  26.43 
 
 		 317 aa  51.2  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4716  hypothetical protein  25.44 
 
 		 321 aa  47.4  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.428888  normal  0.0726517 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0240  hypothetical protein  24.88 
 
 		 290 aa  44.3  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3285  putative PAS/PAC sensor protein  30.07 
 
 		 516 aa  43.1  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>