18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A2350 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A0805  hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  236  9e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2488  hypothetical protein  100 
 
 
123 aa  233  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0109549  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2350  hypothetical protein  100 
 
 
123 aa  233  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0651  hypothetical protein  84.55 
 
 
124 aa  203  6e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0781169  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7087  putative transmembrane protein  67.48 
 
 
123 aa  155  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03755  hypothetical protein  67.77 
 
 
122 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3753  putative transmembrane protein  60 
 
 
129 aa  130  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.196482  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4830  putative transmembrane protein  60 
 
 
129 aa  130  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.973163  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2680  hypothetical protein  55 
 
 
123 aa  121  4e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.776362  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3704  hypothetical protein  48.78 
 
 
146 aa  105  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.385221 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2574  hypothetical protein  38.02 
 
 
138 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2717  hypothetical protein  41.32 
 
 
133 aa  71.6  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.22005  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2339  hypothetical protein  41.32 
 
 
133 aa  71.6  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.964598  normal  0.0789899 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0518  hypothetical protein  42.57 
 
 
131 aa  62  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3285  hypothetical protein  39.78 
 
 
120 aa  44.3  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0224  hypothetical protein  24.07 
 
 
120 aa  40.8  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000354158  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20280  hypothetical protein  36.26 
 
 
121 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.333652  normal  0.366346 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6934  hypothetical protein  34.74 
 
 
129 aa  40.4  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.772274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>