28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0728 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0728  hypothetical protein  100 
 
 
52 aa  104  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0682  hypothetical protein  100 
 
 
52 aa  104  4e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3865  hypothetical protein  100 
 
 
48 aa  97.1  7e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2332  hypothetical protein  77.08 
 
 
48 aa  79  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0895  hypothetical protein  77.08 
 
 
48 aa  77.4  0.00000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0744293  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0891  hypothetical protein  77.08 
 
 
48 aa  77.4  0.00000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1791  hypothetical protein  71.74 
 
 
46 aa  70.5  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.601351  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1180  hypothetical protein  65.96 
 
 
66 aa  68.6  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.278308  normal  0.0615222 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1502  protein of unknown function DUF1127  64.58 
 
 
48 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6602  protein of unknown function DUF1127  62.5 
 
 
48 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000878075 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5661  protein of unknown function DUF1127  62.5 
 
 
48 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.647025  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3375  hypothetical protein  58.33 
 
 
48 aa  62.4  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1700  protein of unknown function DUF1127  58.33 
 
 
48 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.966723  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6084  protein of unknown function DUF1127  58.33 
 
 
48 aa  60.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2481  hypothetical protein  60 
 
 
49 aa  58.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.123002  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5587  hypothetical protein  59.57 
 
 
48 aa  59.3  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.512418  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5370  hypothetical protein  59.57 
 
 
48 aa  58.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.157659 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2773  hypothetical protein  60.47 
 
 
124 aa  54.7  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.573316  normal  0.709682 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3291  hypothetical protein  52.27 
 
 
51 aa  52  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2193  protein of unknown function DUF1127  61.7 
 
 
50 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0418  hypothetical protein  45.65 
 
 
75 aa  45.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2496  hypothetical protein  55.32 
 
 
120 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.175447  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1572  hypothetical protein  64.71 
 
 
48 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713937  normal  0.572982 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0075  hypothetical protein  45.45 
 
 
50 aa  43.1  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0044933  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2771  hypothetical protein  50 
 
 
50 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.167361 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3167  protein of unknown function DUF1127  50 
 
 
50 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.170768  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2772  hypothetical protein  47.62 
 
 
50 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.559182  normal  0.91457 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2727  hypothetical protein  47.62 
 
 
50 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.172753  normal  0.226683 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>