19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_0302 on replicon NC_008835
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008835  BMA10229_0302  amino acid adenylation  100 
 
 
51 aa  103  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0272  thiotemplate mechanism natural product synthetase  100 
 
 
4239 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1709  non-ribosomal peptide synthase  100 
 
 
4265 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1795  syringomycin synthetase  100 
 
 
4265 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1705  amino acid adenylation  63.16 
 
 
4186 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.254367 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  52.63 
 
 
3291 aa  48.5  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3737  amino acid adenylation domain protein  50 
 
 
3824 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0118377 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3683  amino acid adenylation domain protein  50 
 
 
2664 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  50 
 
 
2867 aa  46.2  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1748  amino acid adenylation domain protein  56.41 
 
 
7712 aa  44.7  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.970061 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  47.37 
 
 
3498 aa  43.9  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  56.76 
 
 
5929 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4720  acetoacetyl-CoA synthase  55.26 
 
 
1021 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  48.72 
 
 
4882 aa  41.2  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4838  amino acid adenylation  50 
 
 
1436 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0776089 
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  56.41 
 
 
5953 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2109  AMP-dependent synthetase and ligase  51.35 
 
 
991 aa  40.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.911479  normal  0.633615 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  43.59 
 
 
6661 aa  40.4  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  51.28 
 
 
5926 aa  40.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>