15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_t0049 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_t0049  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  178  1e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1363  tRNA-Ser  95.45 
 
 		 90 bp  143  8e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0006  tRNA-Ser  85.71 
 
 		 90 bp  65.9  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.286369  normal  0.0478712 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0056  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 94 bp  50.1  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.124378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0008  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 93 bp  50.1  0.00009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0008  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 93 bp  50.1  0.00009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.183333  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0047  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 93 bp  50.1  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00947013  normal  0.245138 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0014  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 96 bp  50.1  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000019033  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4314  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.650713  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0002  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 94 bp  44.1  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00386906  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0034  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0025  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0046  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.574265  normal  0.350655 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0693  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.474053  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0004  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 95 bp  44.1  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000366814 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>