36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5644 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_5644  hypothetical protein  100 
 
 
324 aa  664    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5642  hypothetical protein  55.76 
 
 
316 aa  353  2e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3365  hypothetical protein  30.1 
 
 
246 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.668804  normal  0.0254427 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1531  hypothetical protein  33.7 
 
 
265 aa  70.1  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.842491  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1603  methyltransferase  26.84 
 
 
250 aa  66.2  0.0000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0961948  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3940  macrocin-O-methyltransferase  28.57 
 
 
301 aa  63.2  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.881995  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2182  macrocin-O-methyltransferase  36.88 
 
 
166 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.321151 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2516  methyltransferase  26.56 
 
 
230 aa  57.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.524649  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1116  macrocin-O-methyltransferase  24.14 
 
 
281 aa  58.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1835  putative methyltransferase  27.75 
 
 
258 aa  57  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1129  bacteriocin O-metyltransferase  33.04 
 
 
281 aa  55.8  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1290  putative bacteriocin O-metyltransferase  33.04 
 
 
281 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.133264 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1366  putative bacteriocin O-metyltransferase  33.04 
 
 
281 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1109  O-methyltransferase  33.04 
 
 
281 aa  56.2  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1103  O-methyltransferase  33.04 
 
 
281 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0930  macrocin-O-methyltransferase  31.3 
 
 
281 aa  55.1  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4080  macrocin O-methyltransferase  27.27 
 
 
281 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.310855  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1318  hypothetical protein  33.09 
 
 
227 aa  55.1  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.575066  hitchhiker  0.000000517485 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2046  hypothetical protein  27.38 
 
 
257 aa  55.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.15378  hitchhiker  0.00220889 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1261  macrocin O-methyltransferase  27.84 
 
 
281 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1328  bacteriocin O-metyltransferase, putative  32.17 
 
 
281 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1221  bacteriocin O-metyltransferase  32.17 
 
 
281 aa  53.9  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2056  hypothetical protein  26.56 
 
 
257 aa  52  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2577  macrocin-O-methyltransferase domain-containing protein  27.69 
 
 
268 aa  48.5  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000150088  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2351  macrocin-O-methyltransferase  30.3 
 
 
557 aa  48.1  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1291  macrocin-O-methyltransferase  44.64 
 
 
291 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2025  hypothetical protein  23.44 
 
 
236 aa  47.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3953  hypothetical protein  26.4 
 
 
246 aa  46.2  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.686057  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2848  macrocin-O-methyltransferase domain-containing protein  26.47 
 
 
261 aa  45.4  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.360921  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2171  hypothetical protein  30.13 
 
 
213 aa  45.8  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.3355  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4288  hypothetical protein  30.6 
 
 
282 aa  45.4  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.414495  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1480  hypothetical protein  30.57 
 
 
232 aa  45.4  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.213383  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4591  methyltransferase  31.69 
 
 
158 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287622  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1203  putative methyltransferase  26.54 
 
 
266 aa  45.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.139767  normal  0.896147 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4202  hypothetical protein  26.55 
 
 
250 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.994524 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3453  macrocin-O-methyltransferase domain-containing protein  27.41 
 
 
485 aa  43.1  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>