46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2049 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2049  hypothetical protein  100 
 
 		 275 aa  548  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.451143 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4658  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  59.12 
 
 		 275 aa  323  2e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0200  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  56.88 
 
 		 298 aa  321  9.000000000000001e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1729  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  58.52 
 
 		 271 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2048  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  58.52 
 
 		 271 aa  311  5.999999999999999e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.161295  normal  0.743835 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1085  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  57.04 
 
 		 271 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.196121  normal  0.0196192 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4792  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  59.48 
 
 		 275 aa  294  1e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.239471  normal  0.0732889 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1288  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  51.82 
 
 		 276 aa  287  1e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal  0.614779 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2694  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  51.84 
 
 		 282 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.740647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3421  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  51.56 
 
 		 323 aa  271  1e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3201  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  50.53 
 
 		 310 aa  265  8e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5280  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  50.54 
 
 		 275 aa  255  6e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.970105  normal  0.551146 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1809  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  43.64 
 
 		 271 aa  216  2e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2636  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  47.25 
 
 		 262 aa  214  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2074  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  44.7 
 
 		 292 aa  211  1e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.334644  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2788  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  45.17 
 
 		 273 aa  201  7e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000742326 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1389  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  44.07 
 
 		 260 aa  201  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.955887  hitchhiker  0.00580332 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2968  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding protein  38.6 
 
 		 1139 aa  167  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2020  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  34.73 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3561  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  32.84 
 
 		 292 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1137  dehydrogenase  29.46 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.351482  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4273  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  28.64 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2699  xanthine dehydrogenase small subunit  25.53 
 
 		 499 aa  57  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2176  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  31.52 
 
 		 275 aa  55.5  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0299  glyceraldehyde oxidoreductase medium chain  26.6 
 
 		 280 aa  51.6  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1291  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  29.15 
 
 		 292 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1453  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  29.15 
 
 		 292 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.939597 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2949  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  30.91 
 
 		 273 aa  50.4  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000190078 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0415  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  30.28 
 
 		 284 aa  49.7  0.00005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2772  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  27.81 
 
 		 283 aa  49.3  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000137285  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2603  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  29.24 
 
 		 468 aa  48.9  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5969  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  26.9 
 
 		 275 aa  48.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.862592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4005  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  28.11 
 
 		 287 aa  47.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.218277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5002  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  31.25 
 
 		 512 aa  47.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1130  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  32.95 
 
 		 507 aa  47.4  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.16283  normal  0.329933 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2153  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  25.14 
 
 		 292 aa  46.6  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.891805 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2646  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  29.66 
 
 		 283 aa  46.2  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4506  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding:CO dehydrogenase flavoprotein, C-terminal  25.37 
 
 		 329 aa  45.8  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1444  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  30 
 
 		 280 aa  45.8  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3730  putative carbon monoxide dehydrogenase medium subunit, coxM-like protein  29.51 
 
 		 286 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0552  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  30.86 
 
 		 288 aa  44.3  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1819  medium FAD-binding subunit of molybdenum enzyme  26.09 
 
 		 280 aa  43.5  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1982  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  32.57 
 
 		 281 aa  42.7  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.69228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10380  carbon monoxyde dehydrogenase medium subunit  29.03 
 
 		 300 aa  42.7  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121172  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3907  xanthine dehydrogenase, small subunit  28.15 
 
 		 542 aa  42.4  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2134  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding:CO dehydrogenase flavoprotein-like  31.51 
 
 		 289 aa  42.4  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>