16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0991 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0991  hypothetical protein  100 
 
 		 335 aa  682    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.569438  normal  0.641944 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1002  hypothetical protein  39.51 
 
 		 355 aa  224  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.463703 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1294  hypothetical protein  31.21 
 
 		 354 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2922  hypothetical protein  28.01 
 
 		 372 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.266942 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3440  hypothetical protein  29.82 
 
 		 372 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2496  hypothetical protein  30.12 
 
 		 372 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.739127  normal  0.65179 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2323  hypothetical protein  29.22 
 
 		 372 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1068  Capsular polysaccharide biosynthesis protein- like protein  28.08 
 
 		 374 aa  55.1  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  29.13 
 
 		 3301 aa  53.1  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 		 3172 aa  53.1  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5188  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  32.77 
 
 		 423 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3813  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  39.24 
 
 		 306 aa  48.5  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  35.9 
 
 		 979 aa  47.4  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1189  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  30.43 
 
 		 630 aa  44.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.099685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5189  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  27.73 
 
 		 423 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.483793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4387  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  28.3 
 
 		 440 aa  43.5  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.329255 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>