9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1002 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1002  hypothetical protein  100 
 
 		 355 aa  730    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.463703 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0991  hypothetical protein  41.09 
 
 		 335 aa  233  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.569438  normal  0.641944 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1294  hypothetical protein  32.58 
 
 		 354 aa  138  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2922  hypothetical protein  29.75 
 
 		 372 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.266942 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3440  hypothetical protein  29.05 
 
 		 372 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2496  hypothetical protein  29.76 
 
 		 372 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.739127  normal  0.65179 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2323  hypothetical protein  29.72 
 
 		 372 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  25.77 
 
 		 979 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0344  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like  30 
 
 		 380 aa  43.1  0.007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.422128  normal  0.156602 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>