16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BAS3426 on replicon NC_005945
Organism: Bacillus anthracis str. Sterne



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005945  BAS3426  cytidine deaminase  100 
 
 
142 aa  300  6.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3387  cytidine deaminase  100 
 
 
142 aa  300  6.000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.274562  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3696  cytidine deaminase  100 
 
 
142 aa  300  6.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.398657  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3646  cytidine deaminase  100 
 
 
142 aa  300  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3338  cytidine deaminase  98.59 
 
 
142 aa  296  9e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3668  cytidine deaminase  97.89 
 
 
142 aa  294  2e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0231868  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3478  cytidine deaminase  89.44 
 
 
142 aa  274  2e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2140  cytidine deaminase  42.96 
 
 
143 aa  116  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.621603  normal  0.187784 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3067  cytidine deaminase  26.77 
 
 
130 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00456588  decreased coverage  0.0000000642957 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6907  hypothetical protein  25.19 
 
 
139 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.373552 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1286  cytidine deaminase, homotetrameric  25.93 
 
 
149 aa  42.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.887812  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3635  cytidine deaminase  26.79 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.825648 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1001  cytidine deaminase  25.95 
 
 
137 aa  42  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4191  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  23.2 
 
 
147 aa  41.2  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2273  cytidine deaminase  26.15 
 
 
132 aa  40.8  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1988  cytidine deaminase  26.15 
 
 
132 aa  40.4  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>