22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_50090 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_50090  myo-inositol catabolism protein  100 
 
 		 280 aa  558  1e-158  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3496  iolI protein  71.43 
 
 		 276 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.179599  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3270  AP endonuclease  69.6 
 
 		 276 aa  383  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.187779  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1245  putative protein implicated IN myo-inositol catabolique pathway  53.9 
 
 		 273 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.481181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3284  xylose isomerase domain-containing protein  55.51 
 
 		 276 aa  280  2e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00754219 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2738  xylose isomerase domain-containing protein  54.31 
 
 		 276 aa  279  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.413569  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6026  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  53.9 
 
 		 270 aa  278  5e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0110067  normal  0.529558 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6013  xylose isomerase-like TIM barrel  53.11 
 
 		 275 aa  278  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.920316  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7181  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  54.28 
 
 		 270 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.123498  normal  0.0907339 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2074  xylose isomerase-like TIM barrel  52.96 
 
 		 274 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.270414  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2685  xylose isomerase domain-containing protein  52.96 
 
 		 274 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4269  xylose isomerase domain-containing protein  52.03 
 
 		 271 aa  270  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.596763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0612  xylose isomerase domain-containing protein  53.53 
 
 		 275 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2926  xylose isomerase domain-containing protein  54.72 
 
 		 273 aa  267  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.369308  normal  0.384731 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2714  xylose isomerase domain-containing protein  52.96 
 
 		 274 aa  264  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7806  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  53.38 
 
 		 261 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2319  xylose isomerase domain-containing protein  52.42 
 
 		 262 aa  239  4e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1677  xylose isomerase domain-containing protein  52.42 
 
 		 266 aa  238  6.999999999999999e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.117047  normal  0.802625 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4717  xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.87 
 
 		 271 aa  151  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.260427  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4665  xylose isomerase domain-containing protein  32.95 
 
 		 278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02058  hypothetical protein  28.72 
 
 		 626 aa  48.1  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0224521  normal  0.842888 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5035  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  27.54 
 
 		 632 aa  42.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>