29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_04550 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_04550  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  256  6e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5880  hypothetical protein  76.52 
 
 
132 aa  185  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.4721  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67940  hypothetical protein  75 
 
 
132 aa  169  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399454  hitchhiker  0.00937043 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0103  GCN5-related N-acetyltransferase  48.48 
 
 
148 aa  75.5  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0097  GCN5-related N-acetyltransferase  44.9 
 
 
148 aa  70.1  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0227  GCN5-related N-acetyltransferase  39.8 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0520  hypothetical protein  41.84 
 
 
151 aa  59.3  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309605  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3975  GCN5-related N-acetyltransferase  37.76 
 
 
130 aa  53.9  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.255915  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3669  acetyltransferase  37.76 
 
 
130 aa  53.9  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0287377  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0243  acetyltransferase  37.76 
 
 
130 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.423329  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3873  GCN5-related N-acetyltransferase  35 
 
 
143 aa  50.1  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.733855  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4060  GCN5-related N-acetyltransferase  37 
 
 
139 aa  48.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3213  hypothetical protein  38.2 
 
 
140 aa  46.2  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.432533 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3936  GNAT family acetyltransferase  35.71 
 
 
127 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3834  acetyltransferase, gnat family  35.71 
 
 
127 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.527469  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3877  GNAT family acetyltransferase  35.71 
 
 
127 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3757  acetyltransferase, gnat family  35.71 
 
 
127 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.41105  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3768  acetyltransferase, gnat family  35.71 
 
 
127 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0257  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 
127 aa  41.6  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03261  hypothetical protein  36.36 
 
 
127 aa  41.6  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4778  acetyltransferase, GNAT family  36.36 
 
 
127 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3863  acetyltransferase, GNAT family  36.36 
 
 
127 aa  41.6  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03308  hypothetical protein  36.36 
 
 
127 aa  41.6  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3658  acetyltransferase  36.36 
 
 
127 aa  41.6  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3862  GCN5-related N-acetyltransferase  33.67 
 
 
127 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.173019 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0256  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 
127 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3742  acetyltransferase  36.36 
 
 
127 aa  41.6  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3940  acetyltransferase  36.36 
 
 
127 aa  41.6  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1631  GCN5-related N-acetyltransferase  38.18 
 
 
146 aa  41.2  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0153962  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>