24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_01370 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_01370  hypothetical protein  100 
 
 
287 aa  589  1e-167  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1418  hypothetical protein  58.42 
 
 
278 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.318013 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0276  hypothetical protein  46.72 
 
 
293 aa  240  2e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.386829  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0218  hypothetical protein  28.04 
 
 
280 aa  103  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.776931  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1543  hypothetical protein  26.26 
 
 
275 aa  103  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1259  hypothetical protein  26.26 
 
 
275 aa  103  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.495677  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0409  hypothetical protein  27.05 
 
 
284 aa  98.2  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.991789  normal  0.340922 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5905  hypothetical protein  31.11 
 
 
288 aa  97.4  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3634  hypothetical protein  25.35 
 
 
298 aa  90.5  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.651721 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1571  hypothetical protein  27.7 
 
 
275 aa  90.5  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0110  hypothetical protein  28.7 
 
 
290 aa  88.2  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.907911 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4464  hypothetical protein  24.92 
 
 
301 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0968  hypothetical protein  25 
 
 
298 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1416  hypothetical protein  26.72 
 
 
280 aa  84.7  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5102  hypothetical protein  25.26 
 
 
300 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1457  hypothetical protein  25.94 
 
 
280 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00609075 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2193  hypothetical protein  26.89 
 
 
276 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0957966  normal  0.567154 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1586  hypothetical protein  24.72 
 
 
281 aa  78.6  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0999  hypothetical protein  25.59 
 
 
285 aa  75.5  0.0000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0735547  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1072  hypothetical protein  24.36 
 
 
300 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0542  hypothetical protein  25.85 
 
 
276 aa  73.2  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.218634  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1245  hypothetical protein  29.17 
 
 
277 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.806576 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3597  hypothetical protein  25.42 
 
 
297 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281094  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0632  hypothetical protein  23.65 
 
 
514 aa  50.8  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.489107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>