34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_8190 on replicon NC_011982
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011982  Avi_8190    100 
 
 		 533 bp  1057    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.531231  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3761    85.95 
 
 		 759 bp  105  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3927    84.62 
 
 		 424 bp  89.7  8e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.821582  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0420  transposase  88.61 
 
 		 369 bp  85.7  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3954    81.14 
 
 		 754 bp  85.7  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2607  transposase  88.61 
 
 		 369 bp  85.7  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2459  transposase  88.61 
 
 		 369 bp  85.7  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2348  transposase  88.61 
 
 		 369 bp  85.7  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00257505  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2028  transposase  88.61 
 
 		 369 bp  85.7  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1688  transposase  88.61 
 
 		 369 bp  85.7  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1642  transposase  88.61 
 
 		 369 bp  85.7  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1526  transposase  88.61 
 
 		 369 bp  85.7  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1320  transposase  88.61 
 
 		 369 bp  85.7  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1299  transposase  88.61 
 
 		 369 bp  85.7  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.594547  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1646  transposase  88.61 
 
 		 369 bp  85.7  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0837  transposase  88.61 
 
 		 369 bp  85.7  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.456928  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0598  transposase  88.61 
 
 		 369 bp  85.7  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4215  transposase, IS4  85.71 
 
 		 396 bp  77.8  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0530  IS5 family transposase orfA  84.62 
 
 		 369 bp  69.9  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0255453  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2660    95.35 
 
 		 404 bp  69.9  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293823  normal  0.612085 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0534  IS5 family transposase orfA  84.62 
 
 		 369 bp  69.9  0.0000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0623  hypothetical protein  88.41 
 
 		 279 bp  65.9  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0407  transposase, IS4  93.18 
 
 		 351 bp  63.9  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.789806  normal  0.45974 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1839  transposase, IS4 family protein  90.24 
 
 		 621 bp  50.1  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.181674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4122  hypothetical protein  90.24 
 
 		 621 bp  50.1  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4791    100 
 
 		 254 bp  48.1  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  100 
 
 		 764 bp  48.1  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  100 
 
 		 764 bp  48.1  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  100 
 
 		 764 bp  48.1  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  100 
 
 		 764 bp  48.1  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  100 
 
 		 764 bp  48.1  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2771  transposase  96.43 
 
 		 387 bp  48.1  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.447174  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3836  hypothetical protein  93.55 
 
 		 357 bp  46.1  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.318271  normal  0.0637146 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4216  IS5 family transposase OrfA  88.37 
 
 		 369 bp  46.1  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>