13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_8095 on replicon NC_011982
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011982  Avi_8095  hypothetical protein  100 
 
 		 295 aa  610  1e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4978  hypothetical protein  63.92 
 
 		 292 aa  374  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4479  hypothetical protein  62.82 
 
 		 290 aa  364  1e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0874335  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0274  hypothetical protein  63.04 
 
 		 288 aa  361  9e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4661  hypothetical protein  62.59 
 
 		 289 aa  360  2e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.782709  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4319  hypothetical protein  61.51 
 
 		 294 aa  352  4e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.646386  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9167  hypothetical protein  59.07 
 
 		 296 aa  344  1e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4753  hypothetical protein  54.61 
 
 		 296 aa  296  2e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0378  hypothetical protein  48.28 
 
 		 276 aa  244  9e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7036  hypothetical protein  52.76 
 
 		 220 aa  218  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2690  hypothetical protein  36.17 
 
 		 332 aa  85.9  8e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000167925  normal  0.0455749 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4216  hypothetical protein  28.05 
 
 		 324 aa  71.6  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3175  hypothetical protein  25.37 
 
 		 252 aa  55.5  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>