12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7063 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7063  conjugal transfer protein Dtr system  100 
 
 		 98 aa  189  8e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9188  conjugal transfer protein Dtr system  73.47 
 
 		 125 aa  136  8.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8049  conjugal transfer protein TraC  66.33 
 
 		 98 aa  118  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8130  conjugal transfer protein TraC  66.33 
 
 		 98 aa  118  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.852257  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5051  conjugal transfer protein TraC  62.24 
 
 		 98 aa  107  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5394  conjugal transfer protein TraC  62.24 
 
 		 98 aa  107  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809119  normal  0.482901 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5515  TraC family protein  66 
 
 		 98 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.675845  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4674  conjugal transfer protein TraC  54.64 
 
 		 86 aa  93.6  7e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.267648  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6102  hypothetical protein  43.42 
 
 		 120 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.61747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9593  conjugal transfer protein Dtr system  44.26 
 
 		 74 aa  53.5  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219001  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5574  hypothetical protein  47.54 
 
 		 92 aa  52  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0726083  normal  0.0249071 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5002  TraC family protein  42.86 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.771758  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>