15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5933 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5933  succinoglycan biosynthesis protein  100 
 
 		 321 aa  654    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4949  ExoV-like protein  71.43 
 
 		 316 aa  479  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.831937  normal  0.31532 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2966  ExoV-like protein  32.7 
 
 		 296 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0575869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3832  succinoglycan biosynthesis ketolase  33.23 
 
 		 304 aa  167  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3215  ExoV-like protein  34.05 
 
 		 300 aa  162  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.717423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0650  ketal pyruvate transferase protein  35.38 
 
 		 299 aa  160  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4913  ExoV-like protein  39.9 
 
 		 285 aa  161  2e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4804  ExoV-like protein  31.76 
 
 		 333 aa  124  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26470  ExoV-like protein  28.37 
 
 		 268 aa  62  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07265  xanthan biosynthesis pyruvyltransferase GumL  26.05 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0789  hypothetical protein  29.33 
 
 		 296 aa  53.5  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01402  exopolysaccharide xanthan biosynthesis pyruvyltransferase GumL  27.43 
 
 		 264 aa  47.4  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1100  xanthan biosynthesis pyruvyltransferase GumL  25 
 
 		 274 aa  47  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4937  hypothetical protein  27.01 
 
 		 696 aa  44.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47160  predicted protein  22.96 
 
 		 390 aa  42.4  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000445115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>