More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5327 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3178  phosphate transporter  85.96 
 
 		 533 aa  889    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0323756  normal  0.21378 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3469  phosphate transporter  85.96 
 
 		 533 aa  889    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.866739 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5327  phosphate transporter  100 
 
 		 534 aa  1064    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1773  phosphate transporter  60.27 
 
 		 538 aa  608  1e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.475806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2657  inorganic phosphate transporter  60.56 
 
 		 542 aa  608  1e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3854  phosphate transporter  62.94 
 
 		 529 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0274  phosphate transporter  60.32 
 
 		 534 aa  603  1.0000000000000001e-171  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.951775  normal  0.240216 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05870  putative phosphate transporter  59.63 
 
 		 540 aa  595  1e-169  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.996994 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4319  phosphate transporter  59.63 
 
 		 537 aa  594  1e-168  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.162719 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3702  phosphate transporter family protein  61.12 
 
 		 484 aa  589  1e-167  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0552  putative phosphate transporter  59.4 
 
 		 536 aa  591  1e-167  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2208  phosphate transporter family protein  64.06 
 
 		 528 aa  585  1e-166  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.757922  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4651  phosphate transporter  60.15 
 
 		 530 aa  585  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1572  phosphate transporter family protein  64.06 
 
 		 494 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0709  phosphate transporter family protein  64.06 
 
 		 528 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0613  phosphate transporter family protein  64.06 
 
 		 528 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2121  phosphate transporter family protein  64.06 
 
 		 528 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.990709  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2029  phosphate transporter family protein  64.06 
 
 		 528 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5180  phosphate transporter  60 
 
 		 530 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.738193 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0357  phosphate transporter  60.34 
 
 		 530 aa  578  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.787035  normal  0.763168 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1637  phosphate transporter  58.71 
 
 		 539 aa  581  1e-164  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.265126  normal  0.287018 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3432  phosphate transporter  61.98 
 
 		 544 aa  579  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0245217  normal  0.231604 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04880  Phosphate transporter  57.6 
 
 		 536 aa  576  1.0000000000000001e-163  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0807  phosphate transporter family protein  63.48 
 
 		 528 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.65234  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2689  phosphate transporter  60.26 
 
 		 546 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.189603  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3676  phosphate transporter  59.23 
 
 		 538 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151212  hitchhiker  0.00000639982 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0970  phosphate transporter  61.37 
 
 		 529 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3244  phosphate transporter  60.53 
 
 		 528 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1668  phosphate transporter  59.8 
 
 		 540 aa  571  1e-161  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.336875 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4305  phosphate transporter  61.34 
 
 		 528 aa  566  1e-160  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.323368 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4977  phosphate transporter  62.06 
 
 		 530 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3076  phosphate transporter  62.06 
 
 		 530 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5291  phosphate transporter  62.06 
 
 		 530 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.398909 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1761  phosphate transporter  58.85 
 
 		 538 aa  561  1e-158  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165402 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1005  phosphate transporter family protein  61.56 
 
 		 543 aa  547  1e-154  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4103  phosphate transporter  59.23 
 
 		 538 aa  542  1e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.348099  normal  0.0644466 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2559  phosphate transporter  60.16 
 
 		 536 aa  525  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.768412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4788  phosphate transporter  57.08 
 
 		 546 aa  523  1e-147  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.607928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5255  phosphate transporter  57.39 
 
 		 546 aa  524  1e-147  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5331  phosphate transporter  53.76 
 
 		 551 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.899751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3866  phosphate transporter  55.28 
 
 		 542 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.860303 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1071  phosphate transporter  54.21 
 
 		 497 aa  474  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.454735  hitchhiker  0.000185026 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4732  phosphate transporter  46.9 
 
 		 473 aa  410  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.84748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4985  phosphate transporter  46.04 
 
 		 473 aa  399  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287414 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10600  Phosphate transporter  46.83 
 
 		 492 aa  395  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4441  phosphate transporter  46.2 
 
 		 497 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.375988  hitchhiker  0.000123098 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1373  phosphate transporter  46 
 
 		 490 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.687008 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4350  phosphate transporter  46 
 
 		 497 aa  389  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115393 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55770  putative phosphate transporter  46.67 
 
 		 489 aa  388  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4859  putative phosphate transporter  46.44 
 
 		 489 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401236  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4312  phosphate transporter family protein  46.92 
 
 		 490 aa  382  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.388601  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4016  phosphate transporter  47.03 
 
 		 490 aa  382  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00600076 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1262  phosphate transporter  46.03 
 
 		 491 aa  379  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1013  phosphate transporter  47.02 
 
 		 490 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000116864 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3409  phosphate transporter  42.54 
 
 		 494 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3484  phosphate transporter  42.28 
 
 		 489 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0878  phosphate transporter  42.28 
 
 		 489 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.214158  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0927  phosphate transporter  42.36 
 
 		 489 aa  372  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.484963 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3045  phosphate transporter  42.07 
 
 		 489 aa  372  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330688  normal  0.118917 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3607  phosphate transporter  42.28 
 
 		 489 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.309683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4203  phosphate transporter  43.56 
 
 		 501 aa  370  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0892  phosphate transporter  42.07 
 
 		 489 aa  372  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.170136  normal  0.621096 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1052  low-affinity inorganic phosphate transporter  42.94 
 
 		 489 aa  368  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3930  phosphate transporter  43.9 
 
 		 504 aa  369  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4486  phosphate transporter  43.56 
 
 		 501 aa  363  3e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3020  phosphate transporter  43.63 
 
 		 489 aa  359  6e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4689  phosphate transporter  42.97 
 
 		 500 aa  354  2e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4117  phosphate transporter  43.4 
 
 		 502 aa  353  4e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4033  low-affinity inorganic phosphate transporter  40.56 
 
 		 498 aa  348  1e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0122  phosphate transporter  40.56 
 
 		 531 aa  348  1e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.361788  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3782  low-affinity inorganic phosphate transporter 1  41.51 
 
 		 499 aa  346  6e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03342  phosphate transporter, low-affinity  42.05 
 
 		 499 aa  346  7e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.306207  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0222  phosphate transporter  42.05 
 
 		 499 aa  346  7e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03295  hypothetical protein  42.05 
 
 		 499 aa  346  7e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.335822  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3692  low-affinity inorganic phosphate transporter 1  42.05 
 
 		 499 aa  346  7e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4839  low-affinity inorganic phosphate transporter 1  42.05 
 
 		 499 aa  346  7e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0223  phosphate transporter  42.05 
 
 		 499 aa  346  7e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3975  low-affinity inorganic phosphate transporter 1  42.05 
 
 		 499 aa  346  7e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4093  phosphate transporter  40.16 
 
 		 498 aa  345  8e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3829  low-affinity inorganic phosphate transporter 1  42.05 
 
 		 499 aa  345  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3859  putative low-affinity inorganic phosphate transporter 2  41.82 
 
 		 498 aa  344  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0686997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3963  low-affinity inorganic phosphate transporter 2  41.82 
 
 		 498 aa  344  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3782  probable low-affinity inorganic phosphate transporter 2  41.82 
 
 		 498 aa  344  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.675569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3792  probable low-affinity inorganic phosphate transporter 2  41.82 
 
 		 498 aa  344  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3902  low-affinity inorganic phosphate transporter 2  41.82 
 
 		 498 aa  344  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3272  low-affinity inorganic phosphate transporter 2  40.24 
 
 		 499 aa  340  4e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02863  phosphate transporter  40.04 
 
 		 499 aa  339  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.485547  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02812  hypothetical protein  40.04 
 
 		 499 aa  339  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.595865  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0706  phosphate transporter  40.04 
 
 		 499 aa  339  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.720208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3454  low-affinity inorganic phosphate transporter 2  39.84 
 
 		 499 aa  339  8e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3167  low-affinity inorganic phosphate transporter 2  39.84 
 
 		 499 aa  339  8e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3907  phosphate transporter  41.53 
 
 		 499 aa  338  1.9999999999999998e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2692  phosphate transporter  39.96 
 
 		 451 aa  338  1.9999999999999998e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.608667  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0709  phosphate transporter  39.84 
 
 		 499 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0055  low-affinity inorganic phosphate transporter  40.41 
 
 		 524 aa  337  3.9999999999999995e-91  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4299  probable low-affinity inorganic phosphate transporter 2  36.26 
 
 		 438 aa  249  8e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0331  phosphate transporter  68.99 
 
 		 160 aa  215  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.592641  normal  0.557772 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0688  phosphate transporter  38.21 
 
 		 335 aa  132  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000897538  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0703  phosphate transporter  38.21 
 
 		 335 aa  132  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000147408  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0184  putative phosphate permease  38.43 
 
 		 363 aa  127  4.0000000000000003e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>