51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2324 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2324  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  357  4e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.711911  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1500  Phage P2 baseplate assembly protein GPV-like protein  45.22 
 
 		 157 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.889944  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37480  Phage P2 baseplate assembly gpV-like protein  36.72 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1388  Phage-related baseplate assembly protein V  37.76 
 
 		 221 aa  68.2  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.595566  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0642  prophage LambdaW5, baseplate assembly protein V  30.69 
 
 		 154 aa  62  0.000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.392908  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2341  phage baseplate assembly protein V  36.27 
 
 		 211 aa  62  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.962217  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2302  phage-related baseplate assembly protein V  34.19 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.580845  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1337  hypothetical protein  35.96 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.19388  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4849  phage baseplate assembly protein V  34.65 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2902  phage baseplate assembly protein V  37.37 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.684601 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1827  phage baseplate assembly protein V  33.68 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0087576  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00841  hypothetical protein  30.09 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1294  phage baseplate assembly protein V  32.2 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.455231 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3300  phage baseplate assembly protein V  34.31 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3333  Phage-related baseplate assembly protein V  33.04 
 
 		 175 aa  55.5  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00847  hypothetical protein  30.77 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0869  phage baseplate assembly protein V  33.68 
 
 		 211 aa  54.3  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0625663 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2090  phage baseplate assembly protein V  31.58 
 
 		 213 aa  54.3  0.0000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.041892  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3187  phage baseplate assembly protein V  28.91 
 
 		 213 aa  53.5  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.701564  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3822  phage baseplate assembly protein V  33.33 
 
 		 193 aa  53.5  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0936  phage baseplate assembly protein V  30.77 
 
 		 192 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0194  phage baseplate assembly protein V  31.68 
 
 		 234 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.263934 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2765  phage baseplate assembly protein V  29.81 
 
 		 192 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000252262 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4377  baseplate assembly protein V  29.91 
 
 		 213 aa  52  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000317032 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4337  phage baseplate assembly protein GpV  31 
 
 		 211 aa  52  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0120707 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2384  Phage-related baseplate assembly protein V  31.25 
 
 		 174 aa  52  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0194  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3039  phage baseplate assembly protein GpV  32 
 
 		 211 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000239621 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1925  phage baseplate assembly-like protein  26.77 
 
 		 205 aa  51.6  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.405057 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2854  phage baseplate assembly protein V  26.92 
 
 		 192 aa  51.2  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3051  pyocin R2_PP  38.75 
 
 		 200 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.271158 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3037  phage baseplate assembly protein V  28.85 
 
 		 192 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236294 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4046  phage baseplate assembly protein V  35.16 
 
 		 186 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000659846  hitchhiker  0.000000000000714572 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0590  phage baseplate assembly protein V  29.45 
 
 		 189 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2637  phage baseplate assembly protein V  37.36 
 
 		 241 aa  48.5  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0616276  hitchhiker  0.000571581 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2603  phage baseplate assembly protein V  37.36 
 
 		 217 aa  48.5  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0154554  hitchhiker  0.000000000000278565 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2652  phage baseplate assembly protein V  37.08 
 
 		 194 aa  47.8  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0950236  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1204  phage baseplate assembly protein V  30.4 
 
 		 193 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00690633 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3488  phage baseplate assembly protein V  31.58 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0856237 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01346  phage-related baseplate protein  30.49 
 
 		 187 aa  46.6  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.261049  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0760  hypothetical protein  38.6 
 
 		 185 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0803813  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1937  baseplate assembly protein V  30.39 
 
 		 193 aa  45.1  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3403  baseplate assembly protein V  35.09 
 
 		 187 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1145  phage-related baseplate assembly protein  35.11 
 
 		 195 aa  43.1  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0406  phage-related baseplate assembly protein  35.11 
 
 		 195 aa  43.1  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0738  Phage baseplate assembly protein V  32.47 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08010  hypothetical protein  40 
 
 		 185 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000196385  hitchhiker  0.000218842 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01988  hypothetical protein  34.25 
 
 		 212 aa  42  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1165  phage baseplate assembly protein V  34.04 
 
 		 195 aa  41.6  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0364  phage baseplate assembly protein V  34.04 
 
 		 195 aa  41.6  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1139  Phage baseplate assembly protein V  30.86 
 
 		 202 aa  41.2  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1868  phage baseplate assembly protein V  24.18 
 
 		 226 aa  41.2  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>