25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0589 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0589  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  170  5.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0196  hypothetical protein  64.77 
 
 		 88 aa  123  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0225  hypothetical protein  65.91 
 
 		 88 aa  121  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0308  hypothetical protein  56.82 
 
 		 88 aa  108  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0322  hypothetical protein  56.82 
 
 		 88 aa  108  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.835097  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0401  hypothetical protein  56.82 
 
 		 88 aa  103  9e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0158  hypothetical protein  61.36 
 
 		 88 aa  97.1  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.438063  normal  0.749446 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0095  hypothetical protein  52.63 
 
 		 87 aa  81.6  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1035  hypothetical protein  40 
 
 		 91 aa  64.7  0.0000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.537516  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0451  hypothetical protein  37.8 
 
 		 90 aa  62.8  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00606209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0554  hypothetical protein  40.74 
 
 		 101 aa  62.8  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0752  hypothetical protein  41.98 
 
 		 99 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0869  hypothetical protein  38.37 
 
 		 100 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0737512  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0463  hypothetical protein  39.51 
 
 		 101 aa  60.5  0.000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4618  hypothetical protein  39.51 
 
 		 100 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.549833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3348  hypothetical protein  36.56 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.682693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0792  hypothetical protein  39.51 
 
 		 100 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.576927 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1466  hypothetical protein  31.4 
 
 		 89 aa  58.2  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3808  hypothetical protein  34.94 
 
 		 118 aa  57.4  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0320919 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0797  hypothetical protein  39.53 
 
 		 102 aa  57  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.763235  hitchhiker  0.00476248 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3152  hypothetical protein  36.96 
 
 		 122 aa  57  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.412403  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1070  hypothetical protein  40.23 
 
 		 109 aa  57  0.00000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.215268 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3476  hypothetical protein  36.96 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.404419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0541  hypothetical protein  28.57 
 
 		 117 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.752321 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4533  hypothetical protein  31.82 
 
 		 115 aa  42.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.561656  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>