17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0309 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0309  hypothetical protein  100 
 
 		 74 aa  148  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.197458  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3415  hypothetical protein  73.53 
 
 		 69 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.828115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4024  hypothetical protein  73.53 
 
 		 69 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.79125  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4354  hypothetical protein  69.12 
 
 		 69 aa  99  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00524601 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1006  hypothetical protein  64.29 
 
 		 85 aa  85.9  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.542379  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1068  hypothetical protein  66.67 
 
 		 68 aa  85.5  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.164446  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3604  hypothetical protein  54.55 
 
 		 67 aa  76.6  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1314  hypothetical protein  58.73 
 
 		 68 aa  72.8  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00260587  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3034  SlyX family protein  39.06 
 
 		 72 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.159925 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3258  SlyX family protein  39.06 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.549919 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4907  SlyX family protein  39.44 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.576724  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2193  SlyX family protein  35.62 
 
 		 73 aa  45.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4080  SlyX  36.49 
 
 		 71 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.867927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1356  SlyX protein  41.67 
 
 		 73 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000691265  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3225  SlyX family protein  37.5 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2982  SlyX family protein  41.67 
 
 		 73 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.781182 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4007  hypothetical protein  32.31 
 
 		 68 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>