42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_C0088 on replicon NC_007412
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007412  Ava_C0088  putative transposase  100 
 
 
166 aa  334  2.9999999999999997e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.984719  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0993  putative transposase  49.7 
 
 
167 aa  159  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.354831 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3415  putative transposase  49.7 
 
 
167 aa  159  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.125754 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2540  putative transposase  49.7 
 
 
167 aa  159  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.129058  hitchhiker  0.00913494 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2193  putative transposase  49.7 
 
 
167 aa  159  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.213754  normal  0.24508 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2030  putative transposase  49.7 
 
 
167 aa  159  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228939 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1483  putative transposase  49.7 
 
 
167 aa  159  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.120761 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0934  putative transposase  49.7 
 
 
167 aa  159  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.844909  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0616  putative transposase  49.7 
 
 
167 aa  159  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0540  putative transposase  49.7 
 
 
167 aa  159  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0906001  normal  0.114428 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0053  putative transposase  49.7 
 
 
167 aa  159  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0039  putative transposase  49.7 
 
 
167 aa  159  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.455594  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0031  putative transposase  49.7 
 
 
167 aa  159  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0010  putative transposase  49.7 
 
 
167 aa  159  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.430318  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4847  putative transposase  49.7 
 
 
167 aa  159  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4863  putative transposase  49.7 
 
 
167 aa  159  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4924  putative transposase  49.7 
 
 
167 aa  159  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4738  putative transposase  49.09 
 
 
167 aa  158  4e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.026635  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4735  putative transposase  49.09 
 
 
167 aa  158  4e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.294236  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1393  putative transposase  49.09 
 
 
167 aa  158  4e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1006  putative transposase  49.09 
 
 
167 aa  157  6e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.959997 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2118  putative transposase  52.82 
 
 
145 aa  148  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.213018  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2955  putative transposase  49.01 
 
 
151 aa  140  9e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.53153  normal  0.0600936 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2134  putative transposase  42.58 
 
 
160 aa  124  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5821  hypothetical protein  39.77 
 
 
361 aa  117  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2877  hypothetical protein  34.48 
 
 
150 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1333  putative transposase  34.55 
 
 
121 aa  72.4  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0630089  normal  0.783199 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1271  putative transposase, orfA  35.42 
 
 
100 aa  51.2  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.444039  normal  0.0270907 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4578  transposase, putative  37.33 
 
 
343 aa  46.2  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3039  transposase, putative  37.33 
 
 
343 aa  46.2  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2141  transposase, putative  37.33 
 
 
343 aa  46.2  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1910  transposase and inactivated derivative  28.97 
 
 
177 aa  45.1  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.976788 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2574  transposase and inactivated derivative  28.97 
 
 
177 aa  45.1  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0224006  decreased coverage  0.000135385 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2222  transposase and inactivated derivative  33.73 
 
 
162 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000163845  hitchhiker  0.001499 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1831  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.21 
 
 
350 aa  43.9  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.759807 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0002  transposase and inactivated derivative  30.49 
 
 
161 aa  41.6  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.367142 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1345  transposase and inactivated derivative  30.49 
 
 
161 aa  41.6  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.738368  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1360  transposase and inactivated derivative  30.49 
 
 
161 aa  41.6  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2699  transposase and inactivated derivative  30.49 
 
 
161 aa  41.6  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0801317  normal  0.601423 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3194  transposase and inactivated derivative  30.49 
 
 
161 aa  41.6  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435983 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2203  Integrase catalytic region  26.92 
 
 
327 aa  41.2  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0140131  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0725  Transposase-like protein  26.92 
 
 
327 aa  41.2  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.234146  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>