48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_B0242 on replicon NC_007410
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007410  Ava_B0242  transposase  100 
 
 
151 aa  307  2.9999999999999997e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000269989  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0873  hypothetical protein  63.24 
 
 
136 aa  166  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000393117 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2061  hypothetical protein  63.24 
 
 
136 aa  166  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4147  hypothetical protein  63.24 
 
 
136 aa  166  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.406178  normal  0.205919 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4258  hypothetical protein  63.24 
 
 
136 aa  166  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0779487 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4835  hypothetical protein  63.24 
 
 
136 aa  166  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4916  hypothetical protein  63.24 
 
 
136 aa  166  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.362826 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2700  hypothetical protein  38.51 
 
 
149 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2370  transposase  49.48 
 
 
103 aa  89.7  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00301314  normal  0.336671 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2339  hypothetical protein  51.09 
 
 
116 aa  89  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0605  hypothetical protein  63.16 
 
 
74 aa  54.3  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.46051 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4534  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.98 
 
 
332 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0375  transposase and inactivated derivatives-like protein  26.98 
 
 
332 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.263005  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1997  transposase  26.98 
 
 
332 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0643  transposase  26.98 
 
 
332 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4459  transposase  26.98 
 
 
332 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0239  putative transposase  37.18 
 
 
193 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5033  putative transposase  37.18 
 
 
193 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0700761  normal  0.0166306 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6643  putative transposase  37.18 
 
 
193 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2038  transposase  26.02 
 
 
140 aa  41.6  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0393  transposase  26.02 
 
 
140 aa  41.6  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87697  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0457  transposase  26.02 
 
 
140 aa  41.6  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0464  transposase  26.02 
 
 
140 aa  41.6  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.769911  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1309  transposase  26.02 
 
 
140 aa  41.6  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.680652  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1379  transposase  26.02 
 
 
140 aa  41.6  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0494281  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1426  transposase  26.02 
 
 
140 aa  41.6  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0473256  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1464  transposase  26.02 
 
 
140 aa  41.6  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.164431  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1477  transposase  26.02 
 
 
140 aa  41.6  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.209579  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1491  transposase  26.02 
 
 
140 aa  41.6  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.050946  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1616  transposase  26.02 
 
 
140 aa  41.6  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.091531  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1620  transposase  26.02 
 
 
140 aa  41.6  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1632  transposase  26.02 
 
 
140 aa  41.6  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1736  transposase  26.02 
 
 
140 aa  41.6  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000306509  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1065  transposase  26.02 
 
 
140 aa  41.6  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.73558  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1060  transposase  26.02 
 
 
140 aa  41.6  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.575173  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0925  transposase  26.02 
 
 
140 aa  41.6  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.160138  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0918  transposase  26.02 
 
 
140 aa  41.6  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0807  transposase  26.02 
 
 
140 aa  41.6  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0803  transposase  26.02 
 
 
140 aa  41.6  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.333365  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0747  transposase  26.02 
 
 
140 aa  41.6  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0682  transposase  26.02 
 
 
140 aa  41.6  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0349  transposase  26.02 
 
 
140 aa  41.6  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00431305  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0276  transposase  26.02 
 
 
140 aa  41.6  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.732422  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2861  transposase  26.02 
 
 
140 aa  41.6  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2448  transposase  26.02 
 
 
140 aa  41.6  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.603192  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1911  transposase  26.02 
 
 
140 aa  41.6  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2535  transposase, putative  36.08 
 
 
124 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0987592  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2039  putative transposase  33.33 
 
 
346 aa  40.4  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0404689 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>