12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4623 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4623  hypothetical protein  100 
 
 
367 aa  753    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.522937  normal  0.127148 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3954  hypothetical protein  74.45 
 
 
365 aa  541  1e-153  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02390  glutamate-cysteine ligase-like protein  35.77 
 
 
392 aa  199  7e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.533448  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1911  carboxylate-amine ligase  28 
 
 
378 aa  54.3  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557399  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0736  carboxylate-amine ligase  21.96 
 
 
380 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2462  carboxylate-amine ligase  27.2 
 
 
389 aa  48.9  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0573  carboxylate-amine ligase  20.77 
 
 
376 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0585  carboxylate-amine ligase  20.77 
 
 
376 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.670394  hitchhiker  0.00946283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0563  carboxylate-amine ligase  20.77 
 
 
376 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.571446 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0171  carboxylate-amine ligase  21.96 
 
 
380 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1633  carboxylate-amine ligase  25 
 
 
376 aa  45.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.816499 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4332  glutamate--cysteine ligase GCS2  23.31 
 
 
380 aa  43.1  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>